Unterschiedliche SSIDs können kontraproduktiv sein, vor allem, wenn es sich um bewegliche Geräte handelt, da die Reichweite vom 5GHz- nicht so weit wie die vom 2,4GHz-Netz ist. So kann es sein, dass ein auf 5GHz "gezwungen es" Gerät im Grenzbereich von 5GHz auf 2,4GHz eine schnellere und stabilere Verbindung hat.
In den letzten 2 Jahren hat sich da einiges getan, damit das Roaming flüssig läuft, so dass auch ich derzeit eigentlich nur Nachteile sehe, die SSIDs zu trennen. Band Steuerung, also das der "WLAN-Sender" die Clients versucht auf 5GHz zu drücken, führte bei mir zu Problemen, aber das unterstützt eine FritzBox anscheinend nicht, diese hat unter den erweiterten Einstellungen die Option, dass die Clients dieses selbst regeln, was ich für sinnig halte.